Peranan Pelabuhan Perikanan sebagai tempat untuk melaksanakan penyuluhan dan pengumpulan data perikanan, termasuk pencatatan kegiatan operasional kapal-kapal penangkap ikan dalam rangka pengelolaan sumberdaya ikan berkelanjutan dan pengendalian penangkapan agar tidak melebihi sumberdaya yang tersedia. Karena pelabuhan perikanan adalah tempat berkumpulnya nelayan, pedagang ikan dan pelaku ekonomi perikanan lainnya maka sangat efektif untuk pelaksanaan berbagai penyuluhan sebab masyarakat sudah terkumpul dengan sendirinya karena aktivitas ekonomi yang dijalankannya di pelabuhan perikanan. Pelabuhan Perikanan yang tidak kalah pentingnya adalah adalah sebagai tempat untuk melaksanakan pemantauan, pengendalian dan pengawasan sumberdaya ikan, karena bila sumberdaya ikan dimanfaatkan melebihi daya dukung, maka kelestarian ikan akan terancam dan produksi dalam jangka panjang akan terus menurun.

Pembangunan Pelabuhan Perikanan berdasarkan Keputusan Menteri KKP RI No.45/KEPMEN-KP/2014 tentang Rencana Induk Pelabuhan Perikanan Nasional. Tipe Pelabuhan yang akan dibangun adalah Pelabuhan Perikan Pantai (PPP) dikenal juga sebagai Pelabuhan perikanan tipe c atau kelas III. Pelabuhan ini dirancang untuk melayani kapal perikanan berukuran 5-15 GT. Pelabuhan ini dapat menampung 50 Kapal atau 500GT sekaligus. Pelabuhan ini juga melayani kapal ikan yang beroperasi di perairan pantai. Jumlah ikan yang didaratkan sekitar 15-20 ton/hari atau sekitar 4.000 ton/ tahun. Pemabangunan ini berlokai di Batu Duyung Kelurahan Sei Enam Kecamatan Bintan Timur.

Pelabuhan Perikanan sebagai kerangka pemasaran dan distribusi hasil tangkapan karena ikan merupakan komoditi yang mempunyai sifat mudah mengalami penurunan mutu dan bahkan rusak sehingga sejak diangkat keatas kapal hingga dibongkar dipelabuhan harus ditangani secara cepat dan tepat untuk mempertahankan mutu yang prima. 6. Peranan Pelabuhan Perikanan sebagai tempat pelaksanaan pembinaan mutu hasil perikanan. Pembinaan dan pengawasan mutu merupakan suatu sistem yang harus dilaksanakan secara menyeluruh dalam proses produksi, distribusi dan pemasaran hasil perikanan. Dalam pelaksanaan sistem tersebut, subsistem yang merupakan ujung tombak adalah manajemen mutu bahan baku/ikan segar, karena produk akhir yang bermutu baik hanya dapat dihasilkan dari bahan baku yang bermutu baik pula. Dalam kaitan ini, pelabuhan perikanan merupakan titik yang paling penting karena pelabuhan merupakan pusat pendaratan ikan, pemasaran dan distribusi ikan hasil tangkapan.

Pemilihan lokasi di kecamatan bintan timur akan mampu menampung kapal nelayan yang lebih banyak. Sehingga akan memudahkan dalam proses bongkar muat hasil tangkapan. Selain itu akan memudahkan kapal-kapal yag bersandar dalam pengisian logistik.

Pendanaan pembangunan Pelabuahan Perikanan ini bersumber dari Anggaran Pemerintah.